Protein–RNA interactions for Protein: F7D1B3

4933402N22Rik, RIKEN cDNA 4933402N22 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402N22RikF7D1B3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402N22RikF7D1B3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402N22RikF7D1B3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402N22RikF7D1B3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402N22RikF7D1B3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402N22RikF7D1B3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402N22RikF7D1B3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402N22RikF7D1B3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402N22RikF7D1B3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402N22RikF7D1B3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402N22RikF7D1B3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402N22RikF7D1B3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933402N22RikF7D1B3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933402N22RikF7D1B3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
4933402N22RikF7D1B3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
4933402N22RikF7D1B3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933402N22RikF7D1B3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
4933402N22RikF7D1B3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933402N22RikF7D1B3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933402N22RikF7D1B3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
4933402N22RikF7D1B3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933402N22RikF7D1B3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933402N22RikF7D1B3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933402N22RikF7D1B3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933402N22RikF7D1B3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933402N22RikF7D1B3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933402N22RikF7D1B3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933402N22RikF7D1B3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933402N22RikF7D1B3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933402N22RikF7D1B3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
4933402N22RikF7D1B3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933402N22RikF7D1B3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933402N22RikF7D1B3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933402N22RikF7D1B3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
4933402N22RikF7D1B3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933402N22RikF7D1B3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933402N22RikF7D1B3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933402N22RikF7D1B3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933402N22RikF7D1B3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933402N22RikF7D1B3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933402N22RikF7D1B3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933402N22RikF7D1B3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933402N22RikF7D1B3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933402N22RikF7D1B3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms