Protein–RNA interactions for Protein: F6ZDS4

Tpr, Nucleoprotein TPR, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TprF6ZDS4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TprF6ZDS4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TprF6ZDS4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TprF6ZDS4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TprF6ZDS4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TprF6ZDS4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TprF6ZDS4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TprF6ZDS4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TprF6ZDS4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TprF6ZDS4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TprF6ZDS4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TprF6ZDS4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TprF6ZDS4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TprF6ZDS4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TprF6ZDS4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TprF6ZDS4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TprF6ZDS4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TprF6ZDS4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TprF6ZDS4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TprF6ZDS4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TprF6ZDS4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TprF6ZDS4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TprF6ZDS4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TprF6ZDS4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TprF6ZDS4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TprF6ZDS4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TprF6ZDS4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TprF6ZDS4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TprF6ZDS4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TprF6ZDS4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TprF6ZDS4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TprF6ZDS4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TprF6ZDS4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TprF6ZDS4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TprF6ZDS4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TprF6ZDS4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TprF6ZDS4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TprF6ZDS4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TprF6ZDS4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TprF6ZDS4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TprF6ZDS4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TprF6ZDS4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TprF6ZDS4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TprF6ZDS4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TprF6ZDS4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TprF6ZDS4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TprF6ZDS4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TprF6ZDS4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TprF6ZDS4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TprF6ZDS4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TprF6ZDS4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TprF6ZDS4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TprF6ZDS4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TprF6ZDS4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TprF6ZDS4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TprF6ZDS4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TprF6ZDS4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TprF6ZDS4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms