Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm8444F6XS56 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm8444F6XS56 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm8444F6XS56 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm8444F6XS56 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8444F6XS56 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8444F6XS56 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8444F6XS56 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8444F6XS56 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8444F6XS56 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8444F6XS56 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm8444F6XS56 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm8444F6XS56 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8444F6XS56 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8444F6XS56 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8444F6XS56 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8444F6XS56 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8444F6XS56 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Gm8444F6XS56 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8444F6XS56 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8444F6XS56 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8444F6XS56 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8444F6XS56 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8444F6XS56 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8444F6XS56 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8444F6XS56 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8444F6XS56 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8444F6XS56 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8444F6XS56 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8444F6XS56 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8444F6XS56 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8444F6XS56 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8444F6XS56 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8444F6XS56 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8444F6XS56 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8444F6XS56 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8444F6XS56 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8444F6XS56 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8444F6XS56 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8444F6XS56 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8444F6XS56 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8444F6XS56 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8444F6XS56 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8444F6XS56 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8444F6XS56 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8444F6XS56 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8444F6XS56 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8444F6XS56 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8444F6XS56 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8444F6XS56 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8444F6XS56 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8444F6XS56 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8444F6XS56 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm8444F6XS56 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm8444F6XS56 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm8444F6XS56 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm8444F6XS56 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm8444F6XS56 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8444F6XS56 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8444F6XS56 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8444F6XS56 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8444F6XS56 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8444F6XS56 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8444F6XS56 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8444F6XS56 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm8444F6XS56 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm8444F6XS56 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8444F6XS56 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8444F6XS56 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8444F6XS56 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm8444F6XS56 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm8444F6XS56 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm8444F6XS56 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm8444F6XS56 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm8444F6XS56 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8444F6XS56 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8444F6XS56 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8444F6XS56 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8444F6XS56 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.6 ms