Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm17555F6U8B9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm17555F6U8B9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm17555F6U8B9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm17555F6U8B9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm17555F6U8B9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm17555F6U8B9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm17555F6U8B9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm17555F6U8B9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm17555F6U8B9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm17555F6U8B9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm17555F6U8B9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm17555F6U8B9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm17555F6U8B9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm17555F6U8B9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm17555F6U8B9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm17555F6U8B9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm17555F6U8B9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm17555F6U8B9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm17555F6U8B9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm17555F6U8B9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm17555F6U8B9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm17555F6U8B9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm17555F6U8B9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm17555F6U8B9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm17555F6U8B9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm17555F6U8B9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm17555F6U8B9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm17555F6U8B9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm17555F6U8B9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm17555F6U8B9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm17555F6U8B9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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