Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
2610001J05RikF2Z3Y9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
2610001J05RikF2Z3Y9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms