Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc74aE9Q9U8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc74aE9Q9U8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc74aE9Q9U8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc74aE9Q9U8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc74aE9Q9U8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc74aE9Q9U8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc74aE9Q9U8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc74aE9Q9U8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc74aE9Q9U8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc74aE9Q9U8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc74aE9Q9U8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc74aE9Q9U8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc74aE9Q9U8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc74aE9Q9U8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc74aE9Q9U8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc74aE9Q9U8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc74aE9Q9U8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc74aE9Q9U8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc74aE9Q9U8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc74aE9Q9U8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc74aE9Q9U8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc74aE9Q9U8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc74aE9Q9U8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc74aE9Q9U8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc74aE9Q9U8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc74aE9Q9U8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc74aE9Q9U8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc74aE9Q9U8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc74aE9Q9U8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc74aE9Q9U8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc74aE9Q9U8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc74aE9Q9U8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc74aE9Q9U8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc74aE9Q9U8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc74aE9Q9U8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc74aE9Q9U8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc74aE9Q9U8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc74aE9Q9U8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc74aE9Q9U8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc74aE9Q9U8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc74aE9Q9U8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc74aE9Q9U8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc74aE9Q9U8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc74aE9Q9U8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc74aE9Q9U8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc74aE9Q9U8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc74aE9Q9U8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc74aE9Q9U8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc74aE9Q9U8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc74aE9Q9U8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc74aE9Q9U8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc74aE9Q9U8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc74aE9Q9U8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc74aE9Q9U8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc74aE9Q9U8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc74aE9Q9U8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc74aE9Q9U8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc74aE9Q9U8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc74aE9Q9U8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc74aE9Q9U8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc74aE9Q9U8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc74aE9Q9U8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc74aE9Q9U8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc74aE9Q9U8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc74aE9Q9U8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc74aE9Q9U8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc74aE9Q9U8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc74aE9Q9U8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc74aE9Q9U8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc74aE9Q9U8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc74aE9Q9U8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc74aE9Q9U8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc74aE9Q9U8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc74aE9Q9U8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc74aE9Q9U8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc74aE9Q9U8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc74aE9Q9U8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc74aE9Q9U8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc74aE9Q9U8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc74aE9Q9U8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc74aE9Q9U8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc74aE9Q9U8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc74aE9Q9U8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc74aE9Q9U8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc74aE9Q9U8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc74aE9Q9U8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc74aE9Q9U8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc74aE9Q9U8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc74aE9Q9U8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc74aE9Q9U8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc74aE9Q9U8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc74aE9Q9U8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc74aE9Q9U8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms