Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7N9

Dnah11, Dynein, axonemal, heavy chain 11, mousemouse

Predictions only

Length 4,488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah11E9Q7N9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnah11E9Q7N9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dnah11E9Q7N9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dnah11E9Q7N9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnah11E9Q7N9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnah11E9Q7N9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnah11E9Q7N9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnah11E9Q7N9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnah11E9Q7N9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnah11E9Q7N9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnah11E9Q7N9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnah11E9Q7N9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnah11E9Q7N9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnah11E9Q7N9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnah11E9Q7N9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnah11E9Q7N9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnah11E9Q7N9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnah11E9Q7N9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnah11E9Q7N9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnah11E9Q7N9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnah11E9Q7N9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnah11E9Q7N9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnah11E9Q7N9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah11E9Q7N9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 347.3 ms