Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srsf11E9Q6E5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srsf11E9Q6E5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srsf11E9Q6E5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srsf11E9Q6E5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srsf11E9Q6E5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srsf11E9Q6E5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srsf11E9Q6E5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Srsf11E9Q6E5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Srsf11E9Q6E5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Srsf11E9Q6E5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Srsf11E9Q6E5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Srsf11E9Q6E5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Srsf11E9Q6E5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srsf11E9Q6E5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srsf11E9Q6E5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Srsf11E9Q6E5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Srsf11E9Q6E5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Srsf11E9Q6E5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srsf11E9Q6E5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srsf11E9Q6E5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Srsf11E9Q6E5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Srsf11E9Q6E5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Srsf11E9Q6E5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Srsf11E9Q6E5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Srsf11E9Q6E5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Srsf11E9Q6E5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Srsf11E9Q6E5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Srsf11E9Q6E5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srsf11E9Q6E5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srsf11E9Q6E5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srsf11E9Q6E5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Srsf11E9Q6E5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Srsf11E9Q6E5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Srsf11E9Q6E5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srsf11E9Q6E5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srsf11E9Q6E5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srsf11E9Q6E5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srsf11E9Q6E5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srsf11E9Q6E5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srsf11E9Q6E5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srsf11E9Q6E5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Srsf11E9Q6E5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Srsf11E9Q6E5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Srsf11E9Q6E5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srsf11E9Q6E5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srsf11E9Q6E5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srsf11E9Q6E5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Srsf11E9Q6E5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srsf11E9Q6E5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srsf11E9Q6E5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srsf11E9Q6E5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srsf11E9Q6E5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srsf11E9Q6E5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srsf11E9Q6E5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srsf11E9Q6E5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srsf11E9Q6E5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srsf11E9Q6E5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srsf11E9Q6E5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Srsf11E9Q6E5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srsf11E9Q6E5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Srsf11E9Q6E5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Srsf11E9Q6E5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Srsf11E9Q6E5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Srsf11E9Q6E5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Srsf11E9Q6E5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srsf11E9Q6E5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Srsf11E9Q6E5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srsf11E9Q6E5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srsf11E9Q6E5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srsf11E9Q6E5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Srsf11E9Q6E5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srsf11E9Q6E5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srsf11E9Q6E5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srsf11E9Q6E5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srsf11E9Q6E5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srsf11E9Q6E5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srsf11E9Q6E5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srsf11E9Q6E5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srsf11E9Q6E5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srsf11E9Q6E5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srsf11E9Q6E5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Srsf11E9Q6E5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Srsf11E9Q6E5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Srsf11E9Q6E5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srsf11E9Q6E5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srsf11E9Q6E5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srsf11E9Q6E5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srsf11E9Q6E5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srsf11E9Q6E5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srsf11E9Q6E5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srsf11E9Q6E5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srsf11E9Q6E5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srsf11E9Q6E5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srsf11E9Q6E5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srsf11E9Q6E5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srsf11E9Q6E5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srsf11E9Q6E5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srsf11E9Q6E5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srsf11E9Q6E5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms