Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
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