Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp3E9Q1T6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp3E9Q1T6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrp3E9Q1T6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrp3E9Q1T6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrp3E9Q1T6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrp3E9Q1T6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrp3E9Q1T6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrp3E9Q1T6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrp3E9Q1T6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrp3E9Q1T6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrp3E9Q1T6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrp3E9Q1T6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrp3E9Q1T6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrp3E9Q1T6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrp3E9Q1T6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrp3E9Q1T6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrp3E9Q1T6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrp3E9Q1T6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrp3E9Q1T6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp3E9Q1T6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrp3E9Q1T6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrp3E9Q1T6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrp3E9Q1T6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp3E9Q1T6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp3E9Q1T6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrp3E9Q1T6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrp3E9Q1T6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp3E9Q1T6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp3E9Q1T6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp3E9Q1T6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp3E9Q1T6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp3E9Q1T6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp3E9Q1T6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp3E9Q1T6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrp3E9Q1T6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrp3E9Q1T6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp3E9Q1T6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp3E9Q1T6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp3E9Q1T6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp3E9Q1T6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp3E9Q1T6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp3E9Q1T6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp3E9Q1T6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrp3E9Q1T6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrp3E9Q1T6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrp3E9Q1T6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp3E9Q1T6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp3E9Q1T6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp3E9Q1T6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp3E9Q1T6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp3E9Q1T6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrp3E9Q1T6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrp3E9Q1T6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrp3E9Q1T6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrp3E9Q1T6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrp3E9Q1T6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrp3E9Q1T6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrp3E9Q1T6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms