Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ddx60E9PZQ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ddx60E9PZQ1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ddx60E9PZQ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ddx60E9PZQ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ddx60E9PZQ1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ddx60E9PZQ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ddx60E9PZQ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ddx60E9PZQ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ddx60E9PZQ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ddx60E9PZQ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ddx60E9PZQ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Ddx60E9PZQ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ddx60E9PZQ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ddx60E9PZQ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ddx60E9PZQ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ddx60E9PZQ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ddx60E9PZQ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ddx60E9PZQ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ddx60E9PZQ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ddx60E9PZQ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ddx60E9PZQ1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ddx60E9PZQ1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Ddx60E9PZQ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ddx60E9PZQ1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ddx60E9PZQ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
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