Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Scaf11E9PZM7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Scaf11E9PZM7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Scaf11E9PZM7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Scaf11E9PZM7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Scaf11E9PZM7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Scaf11E9PZM7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Scaf11E9PZM7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Scaf11E9PZM7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Scaf11E9PZM7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Scaf11E9PZM7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Scaf11E9PZM7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Scaf11E9PZM7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Scaf11E9PZM7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Scaf11E9PZM7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Scaf11E9PZM7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Scaf11E9PZM7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Scaf11E9PZM7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Scaf11E9PZM7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Scaf11E9PZM7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Scaf11E9PZM7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Scaf11E9PZM7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Scaf11E9PZM7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Scaf11E9PZM7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Scaf11E9PZM7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Scaf11E9PZM7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Scaf11E9PZM7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Scaf11E9PZM7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Scaf11E9PZM7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Scaf11E9PZM7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Scaf11E9PZM7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Scaf11E9PZM7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Scaf11E9PZM7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Scaf11E9PZM7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Scaf11E9PZM7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Scaf11E9PZM7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Scaf11E9PZM7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Scaf11E9PZM7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Scaf11E9PZM7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Scaf11E9PZM7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Scaf11E9PZM7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Scaf11E9PZM7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Scaf11E9PZM7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Scaf11E9PZM7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Scaf11E9PZM7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Scaf11E9PZM7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Scaf11E9PZM7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Scaf11E9PZM7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Scaf11E9PZM7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Scaf11E9PZM7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Scaf11E9PZM7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Scaf11E9PZM7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Scaf11E9PZM7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Scaf11E9PZM7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Scaf11E9PZM7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Scaf11E9PZM7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Scaf11E9PZM7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Scaf11E9PZM7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Scaf11E9PZM7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Scaf11E9PZM7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Scaf11E9PZM7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Scaf11E9PZM7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Scaf11E9PZM7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Scaf11E9PZM7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Scaf11E9PZM7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Scaf11E9PZM7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Scaf11E9PZM7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Scaf11E9PZM7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Scaf11E9PZM7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Scaf11E9PZM7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Scaf11E9PZM7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Scaf11E9PZM7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Scaf11E9PZM7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Scaf11E9PZM7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Scaf11E9PZM7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Scaf11E9PZM7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Scaf11E9PZM7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Scaf11E9PZM7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Scaf11E9PZM7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Scaf11E9PZM7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Scaf11E9PZM7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Scaf11E9PZM7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Scaf11E9PZM7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Scaf11E9PZM7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Scaf11E9PZM7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Scaf11E9PZM7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Scaf11E9PZM7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Scaf11E9PZM7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Scaf11E9PZM7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Scaf11E9PZM7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Scaf11E9PZM7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Scaf11E9PZM7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Scaf11E9PZM7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Scaf11E9PZM7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Scaf11E9PZM7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Scaf11E9PZM7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Scaf11E9PZM7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Scaf11E9PZM7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Scaf11E9PZM7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Scaf11E9PZM7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms