Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srp54bE9PXC0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srp54bE9PXC0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srp54bE9PXC0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Srp54bE9PXC0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Srp54bE9PXC0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srp54bE9PXC0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srp54bE9PXC0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srp54bE9PXC0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Srp54bE9PXC0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srp54bE9PXC0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srp54bE9PXC0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srp54bE9PXC0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srp54bE9PXC0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srp54bE9PXC0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srp54bE9PXC0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srp54bE9PXC0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Srp54bE9PXC0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srp54bE9PXC0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srp54bE9PXC0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srp54bE9PXC0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srp54bE9PXC0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srp54bE9PXC0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srp54bE9PXC0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srp54bE9PXC0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srp54bE9PXC0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srp54bE9PXC0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srp54bE9PXC0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srp54bE9PXC0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srp54bE9PXC0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srp54bE9PXC0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srp54bE9PXC0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srp54bE9PXC0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srp54bE9PXC0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srp54bE9PXC0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srp54bE9PXC0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srp54bE9PXC0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srp54bE9PXC0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Srp54bE9PXC0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srp54bE9PXC0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srp54bE9PXC0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srp54bE9PXC0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srp54bE9PXC0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srp54bE9PXC0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Srp54bE9PXC0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srp54bE9PXC0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srp54bE9PXC0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srp54bE9PXC0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srp54bE9PXC0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srp54bE9PXC0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srp54bE9PXC0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srp54bE9PXC0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srp54bE9PXC0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srp54bE9PXC0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srp54bE9PXC0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srp54bE9PXC0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srp54bE9PXC0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srp54bE9PXC0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srp54bE9PXC0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srp54bE9PXC0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srp54bE9PXC0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srp54bE9PXC0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srp54bE9PXC0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srp54bE9PXC0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srp54bE9PXC0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srp54bE9PXC0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srp54bE9PXC0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Srp54bE9PXC0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srp54bE9PXC0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Srp54bE9PXC0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Srp54bE9PXC0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srp54bE9PXC0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srp54bE9PXC0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srp54bE9PXC0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srp54bE9PXC0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srp54bE9PXC0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srp54bE9PXC0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Srp54bE9PXC0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srp54bE9PXC0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srp54bE9PXC0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srp54bE9PXC0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srp54bE9PXC0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srp54bE9PXC0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srp54bE9PXC0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srp54bE9PXC0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srp54bE9PXC0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Srp54bE9PXC0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srp54bE9PXC0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srp54bE9PXC0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srp54bE9PXC0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srp54bE9PXC0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srp54bE9PXC0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srp54bE9PXC0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Srp54bE9PXC0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srp54bE9PXC0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srp54bE9PXC0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srp54bE9PXC0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srp54bE9PXC0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srp54bE9PXC0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srp54bE9PXC0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms