Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sptbn4E9PX29 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sptbn4E9PX29 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sptbn4E9PX29 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sptbn4E9PX29 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sptbn4E9PX29 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sptbn4E9PX29 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn4E9PX29 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn4E9PX29 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn4E9PX29 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sptbn4E9PX29 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sptbn4E9PX29 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sptbn4E9PX29 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sptbn4E9PX29 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sptbn4E9PX29 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sptbn4E9PX29 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sptbn4E9PX29 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sptbn4E9PX29 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sptbn4E9PX29 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sptbn4E9PX29 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptbn4E9PX29 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptbn4E9PX29 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptbn4E9PX29 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptbn4E9PX29 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptbn4E9PX29 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptbn4E9PX29 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptbn4E9PX29 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptbn4E9PX29 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptbn4E9PX29 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptbn4E9PX29 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptbn4E9PX29 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptbn4E9PX29 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptbn4E9PX29 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptbn4E9PX29 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptbn4E9PX29 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptbn4E9PX29 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptbn4E9PX29 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptbn4E9PX29 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptbn4E9PX29 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptbn4E9PX29 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptbn4E9PX29 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptbn4E9PX29 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptbn4E9PX29 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptbn4E9PX29 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptbn4E9PX29 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptbn4E9PX29 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptbn4E9PX29 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptbn4E9PX29 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptbn4E9PX29 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn4E9PX29 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptbn4E9PX29 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptbn4E9PX29 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn4E9PX29 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn4E9PX29 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn4E9PX29 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn4E9PX29 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn4E9PX29 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sptbn4E9PX29 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sptbn4E9PX29 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptbn4E9PX29 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptbn4E9PX29 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptbn4E9PX29 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptbn4E9PX29 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptbn4E9PX29 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptbn4E9PX29 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptbn4E9PX29 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptbn4E9PX29 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptbn4E9PX29 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptbn4E9PX29 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptbn4E9PX29 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptbn4E9PX29 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptbn4E9PX29 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptbn4E9PX29 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptbn4E9PX29 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptbn4E9PX29 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptbn4E9PX29 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms