Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc175E9PVB3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc175E9PVB3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc175E9PVB3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc175E9PVB3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc175E9PVB3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc175E9PVB3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc175E9PVB3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc175E9PVB3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc175E9PVB3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc175E9PVB3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc175E9PVB3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc175E9PVB3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc175E9PVB3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc175E9PVB3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc175E9PVB3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc175E9PVB3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc175E9PVB3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc175E9PVB3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc175E9PVB3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc175E9PVB3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc175E9PVB3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc175E9PVB3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc175E9PVB3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc175E9PVB3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc175E9PVB3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc175E9PVB3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc175E9PVB3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc175E9PVB3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc175E9PVB3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc175E9PVB3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc175E9PVB3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc175E9PVB3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc175E9PVB3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc175E9PVB3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc175E9PVB3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc175E9PVB3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc175E9PVB3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc175E9PVB3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc175E9PVB3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc175E9PVB3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc175E9PVB3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc175E9PVB3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc175E9PVB3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc175E9PVB3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc175E9PVB3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc175E9PVB3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc175E9PVB3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc175E9PVB3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc175E9PVB3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc175E9PVB3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc175E9PVB3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc175E9PVB3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc175E9PVB3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc175E9PVB3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc175E9PVB3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms