Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms