Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa28D3Z1V9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa28D3Z1V9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa28D3Z1V9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa28D3Z1V9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms