Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Trim30cD3YVI9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Trim30cD3YVI9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Trim30cD3YVI9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Trim30cD3YVI9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Trim30cD3YVI9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Trim30cD3YVI9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Trim30cD3YVI9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Trim30cD3YVI9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Trim30cD3YVI9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Trim30cD3YVI9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Trim30cD3YVI9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Trim30cD3YVI9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Trim30cD3YVI9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Trim30cD3YVI9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Trim30cD3YVI9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Trim30cD3YVI9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Trim30cD3YVI9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Trim30cD3YVI9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Trim30cD3YVI9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25,59■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Trim30cD3YVI9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Trim30cD3YVI9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Trim30cD3YVI9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Trim30cD3YVI9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Trim30cD3YVI9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Trim30cD3YVI9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Trim30cD3YVI9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Trim30cD3YVI9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Trim30cD3YVI9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Trim30cD3YVI9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Trim30cD3YVI9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Trim30cD3YVI9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Trim30cD3YVI9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Trim30cD3YVI9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Trim30cD3YVI9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Trim30cD3YVI9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Trim30cD3YVI9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Trim30cD3YVI9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Trim30cD3YVI9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Trim30cD3YVI9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Trim30cD3YVI9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Trim30cD3YVI9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Trim30cD3YVI9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Trim30cD3YVI9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Trim30cD3YVI9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Trim30cD3YVI9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Trim30cD3YVI9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Trim30cD3YVI9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Trim30cD3YVI9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Trim30cD3YVI9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Trim30cD3YVI9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Trim30cD3YVI9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Trim30cD3YVI9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Trim30cD3YVI9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Trim30cD3YVI9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Trim30cD3YVI9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Trim30cD3YVI9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Trim30cD3YVI9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
Trim30cD3YVI9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Trim30cD3YVI9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Trim30cD3YVI9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Trim30cD3YVI9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Trim30cD3YVI9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Trim30cD3YVI9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Trim30cD3YVI9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Trim30cD3YVI9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Trim30cD3YVI9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Trim30cD3YVI9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Trim30cD3YVI9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Trim30cD3YVI9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Trim30cD3YVI9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Trim30cD3YVI9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Trim30cD3YVI9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25,39■■□□□ 1,65
Trim30cD3YVI9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Trim30cD3YVI9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Trim30cD3YVI9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Trim30cD3YVI9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Trim30cD3YVI9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms