Protein–RNA interactions for Protein: B8JJZ9

Zfp563, Zinc finger protein 563, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp563B8JJZ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp563B8JJZ9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp563B8JJZ9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp563B8JJZ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp563B8JJZ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp563B8JJZ9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Zfp563B8JJZ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp563B8JJZ9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp563B8JJZ9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp563B8JJZ9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Zfp563B8JJZ9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp563B8JJZ9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp563B8JJZ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp563B8JJZ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp563B8JJZ9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp563B8JJZ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Zfp563B8JJZ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp563B8JJZ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp563B8JJZ9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp563B8JJZ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Zfp563B8JJZ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp563B8JJZ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp563B8JJZ9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp563B8JJZ9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp563B8JJZ9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp563B8JJZ9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp563B8JJZ9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp563B8JJZ9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Zfp563B8JJZ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp563B8JJZ9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp563B8JJZ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp563B8JJZ9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Zfp563B8JJZ9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Zfp563B8JJZ9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp563B8JJZ9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp563B8JJZ9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp563B8JJZ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp563B8JJZ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp563B8JJZ9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Zfp563B8JJZ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Zfp563B8JJZ9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Zfp563B8JJZ9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Zfp563B8JJZ9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp563B8JJZ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Zfp563B8JJZ9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp563B8JJZ9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp563B8JJZ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp563B8JJZ9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp563B8JJZ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp563B8JJZ9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp563B8JJZ9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp563B8JJZ9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp563B8JJZ9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp563B8JJZ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp563B8JJZ9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp563B8JJZ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp563B8JJZ9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp563B8JJZ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp563B8JJZ9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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