Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21,93■■□□□ 1,1
PtprbB2RU80 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
PtprbB2RU80 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21,93■■□□□ 1,1
PtprbB2RU80 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
PtprbB2RU80 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
PtprbB2RU80 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21,92■■□□□ 1,1
PtprbB2RU80 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
PtprbB2RU80 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,91■■□□□ 1,1
PtprbB2RU80 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21,91■■□□□ 1,1
PtprbB2RU80 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
PtprbB2RU80 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
PtprbB2RU80 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21,9■■□□□ 1,1
PtprbB2RU80 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21,9■■□□□ 1,1
PtprbB2RU80 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
PtprbB2RU80 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
PtprbB2RU80 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
PtprbB2RU80 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
PtprbB2RU80 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
PtprbB2RU80 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
PtprbB2RU80 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
PtprbB2RU80 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21,88■■□□□ 1,09
PtprbB2RU80 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
PtprbB2RU80 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
PtprbB2RU80 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
PtprbB2RU80 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
PtprbB2RU80 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
PtprbB2RU80 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
PtprbB2RU80 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21,84■■□□□ 1,09
PtprbB2RU80 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21,83■■□□□ 1,09
PtprbB2RU80 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,08
PtprbB2RU80 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,08
PtprbB2RU80 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,83■■□□□ 1,08
PtprbB2RU80 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21,82■■□□□ 1,08
PtprbB2RU80 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
PtprbB2RU80 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
PtprbB2RU80 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
PtprbB2RU80 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21,79■■□□□ 1,08
PtprbB2RU80 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
PtprbB2RU80 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
PtprbB2RU80 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21,79■■□□□ 1,08
PtprbB2RU80 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
PtprbB2RU80 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,78■■□□□ 1,08
PtprbB2RU80 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
PtprbB2RU80 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21,77■■□□□ 1,08
PtprbB2RU80 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
PtprbB2RU80 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
PtprbB2RU80 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21,77■■□□□ 1,08
PtprbB2RU80 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
PtprbB2RU80 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
PtprbB2RU80 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21,77■■□□□ 1,07
PtprbB2RU80 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
PtprbB2RU80 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
PtprbB2RU80 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
PtprbB2RU80 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21,75■■□□□ 1,07
PtprbB2RU80 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
PtprbB2RU80 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21,74■■□□□ 1,07
PtprbB2RU80 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21,74■■□□□ 1,07
PtprbB2RU80 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
PtprbB2RU80 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21,73■■□□□ 1,07
PtprbB2RU80 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
PtprbB2RU80 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,72■■□□□ 1,07
PtprbB2RU80 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
PtprbB2RU80 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,72■■□□□ 1,07
PtprbB2RU80 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,71■■□□□ 1,07
PtprbB2RU80 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21,7■■□□□ 1,07
PtprbB2RU80 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
PtprbB2RU80 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
PtprbB2RU80 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,7■■□□□ 1,06
PtprbB2RU80 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
PtprbB2RU80 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21,68■■□□□ 1,06
PtprbB2RU80 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
PtprbB2RU80 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,67■■□□□ 1,06
PtprbB2RU80 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
PtprbB2RU80 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21,67■■□□□ 1,06
PtprbB2RU80 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
PtprbB2RU80 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
PtprbB2RU80 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
PtprbB2RU80 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
PtprbB2RU80 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
PtprbB2RU80 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
PtprbB2RU80 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21,65■■□□□ 1,06
PtprbB2RU80 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21,65■■□□□ 1,06
PtprbB2RU80 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
PtprbB2RU80 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
PtprbB2RU80 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
PtprbB2RU80 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
PtprbB2RU80 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
PtprbB2RU80 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
PtprbB2RU80 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21,63■■□□□ 1,05
PtprbB2RU80 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21,63■■□□□ 1,05
PtprbB2RU80 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
PtprbB2RU80 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21,63■■□□□ 1,05
PtprbB2RU80 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
PtprbB2RU80 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,62■■□□□ 1,05
PtprbB2RU80 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
PtprbB2RU80 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
PtprbB2RU80 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
PtprbB2RU80 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
PtprbB2RU80 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
PtprbB2RU80 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21,59■■□□□ 1,05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31,7 ms