Protein–RNA interactions for Protein: A9Z1V5

Vwa5b1, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B1, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b1A9Z1V5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Vwa5b1A9Z1V5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vwa5b1A9Z1V5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vwa5b1A9Z1V5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vwa5b1A9Z1V5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vwa5b1A9Z1V5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vwa5b1A9Z1V5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vwa5b1A9Z1V5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vwa5b1A9Z1V5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vwa5b1A9Z1V5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vwa5b1A9Z1V5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vwa5b1A9Z1V5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vwa5b1A9Z1V5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vwa5b1A9Z1V5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vwa5b1A9Z1V5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vwa5b1A9Z1V5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vwa5b1A9Z1V5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vwa5b1A9Z1V5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vwa5b1A9Z1V5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vwa5b1A9Z1V5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vwa5b1A9Z1V5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vwa5b1A9Z1V5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vwa5b1A9Z1V5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa5b1A9Z1V5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa5b1A9Z1V5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vwa5b1A9Z1V5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vwa5b1A9Z1V5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vwa5b1A9Z1V5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vwa5b1A9Z1V5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vwa5b1A9Z1V5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vwa5b1A9Z1V5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vwa5b1A9Z1V5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vwa5b1A9Z1V5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa5b1A9Z1V5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa5b1A9Z1V5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vwa5b1A9Z1V5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vwa5b1A9Z1V5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vwa5b1A9Z1V5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa5b1A9Z1V5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vwa5b1A9Z1V5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vwa5b1A9Z1V5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa5b1A9Z1V5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa5b1A9Z1V5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa5b1A9Z1V5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vwa5b1A9Z1V5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vwa5b1A9Z1V5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vwa5b1A9Z1V5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vwa5b1A9Z1V5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa5b1A9Z1V5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa5b1A9Z1V5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vwa5b1A9Z1V5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa5b1A9Z1V5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa5b1A9Z1V5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa5b1A9Z1V5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa5b1A9Z1V5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa5b1A9Z1V5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa5b1A9Z1V5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vwa5b1A9Z1V5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vwa5b1A9Z1V5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vwa5b1A9Z1V5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vwa5b1A9Z1V5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vwa5b1A9Z1V5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vwa5b1A9Z1V5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vwa5b1A9Z1V5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vwa5b1A9Z1V5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vwa5b1A9Z1V5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vwa5b1A9Z1V5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vwa5b1A9Z1V5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vwa5b1A9Z1V5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vwa5b1A9Z1V5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vwa5b1A9Z1V5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vwa5b1A9Z1V5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vwa5b1A9Z1V5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vwa5b1A9Z1V5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vwa5b1A9Z1V5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vwa5b1A9Z1V5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vwa5b1A9Z1V5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa5b1A9Z1V5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa5b1A9Z1V5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa5b1A9Z1V5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa5b1A9Z1V5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vwa5b1A9Z1V5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vwa5b1A9Z1V5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa5b1A9Z1V5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa5b1A9Z1V5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa5b1A9Z1V5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa5b1A9Z1V5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vwa5b1A9Z1V5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vwa5b1A9Z1V5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vwa5b1A9Z1V5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vwa5b1A9Z1V5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vwa5b1A9Z1V5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vwa5b1A9Z1V5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vwa5b1A9Z1V5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vwa5b1A9Z1V5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa5b1A9Z1V5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa5b1A9Z1V5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa5b1A9Z1V5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa5b1A9Z1V5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa5b1A9Z1V5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms