Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem238A9JSM3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem238A9JSM3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms