Protein–RNA interactions for Protein: A6H8H5

Kcnb2, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb2A6H8H5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kcnb2A6H8H5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kcnb2A6H8H5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kcnb2A6H8H5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Kcnb2A6H8H5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kcnb2A6H8H5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kcnb2A6H8H5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kcnb2A6H8H5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kcnb2A6H8H5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kcnb2A6H8H5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kcnb2A6H8H5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kcnb2A6H8H5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kcnb2A6H8H5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kcnb2A6H8H5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kcnb2A6H8H5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kcnb2A6H8H5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kcnb2A6H8H5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kcnb2A6H8H5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kcnb2A6H8H5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kcnb2A6H8H5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kcnb2A6H8H5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kcnb2A6H8H5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kcnb2A6H8H5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kcnb2A6H8H5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kcnb2A6H8H5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kcnb2A6H8H5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kcnb2A6H8H5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kcnb2A6H8H5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kcnb2A6H8H5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kcnb2A6H8H5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcnb2A6H8H5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcnb2A6H8H5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcnb2A6H8H5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcnb2A6H8H5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kcnb2A6H8H5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcnb2A6H8H5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kcnb2A6H8H5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kcnb2A6H8H5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kcnb2A6H8H5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kcnb2A6H8H5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kcnb2A6H8H5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kcnb2A6H8H5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kcnb2A6H8H5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kcnb2A6H8H5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kcnb2A6H8H5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kcnb2A6H8H5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kcnb2A6H8H5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kcnb2A6H8H5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kcnb2A6H8H5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kcnb2A6H8H5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kcnb2A6H8H5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kcnb2A6H8H5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kcnb2A6H8H5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kcnb2A6H8H5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kcnb2A6H8H5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kcnb2A6H8H5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kcnb2A6H8H5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Kcnb2A6H8H5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kcnb2A6H8H5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kcnb2A6H8H5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kcnb2A6H8H5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kcnb2A6H8H5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kcnb2A6H8H5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kcnb2A6H8H5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kcnb2A6H8H5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kcnb2A6H8H5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kcnb2A6H8H5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kcnb2A6H8H5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kcnb2A6H8H5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kcnb2A6H8H5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kcnb2A6H8H5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kcnb2A6H8H5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kcnb2A6H8H5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kcnb2A6H8H5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kcnb2A6H8H5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms