Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf39A2RT81 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf39A2RT81 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf39A2RT81 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf39A2RT81 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms