Protein–RNA interactions for Protein: A2RT62

Fbxl16, F-box/LRR-repeat protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxl16A2RT62 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fbxl16A2RT62 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fbxl16A2RT62 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fbxl16A2RT62 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fbxl16A2RT62 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fbxl16A2RT62 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fbxl16A2RT62 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fbxl16A2RT62 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fbxl16A2RT62 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fbxl16A2RT62 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fbxl16A2RT62 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fbxl16A2RT62 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fbxl16A2RT62 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fbxl16A2RT62 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fbxl16A2RT62 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fbxl16A2RT62 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fbxl16A2RT62 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fbxl16A2RT62 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fbxl16A2RT62 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fbxl16A2RT62 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fbxl16A2RT62 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fbxl16A2RT62 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fbxl16A2RT62 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fbxl16A2RT62 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fbxl16A2RT62 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fbxl16A2RT62 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fbxl16A2RT62 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fbxl16A2RT62 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Fbxl16A2RT62 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fbxl16A2RT62 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fbxl16A2RT62 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fbxl16A2RT62 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fbxl16A2RT62 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fbxl16A2RT62 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fbxl16A2RT62 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fbxl16A2RT62 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fbxl16A2RT62 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fbxl16A2RT62 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fbxl16A2RT62 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fbxl16A2RT62 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fbxl16A2RT62 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fbxl16A2RT62 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fbxl16A2RT62 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fbxl16A2RT62 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fbxl16A2RT62 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fbxl16A2RT62 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fbxl16A2RT62 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fbxl16A2RT62 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fbxl16A2RT62 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fbxl16A2RT62 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fbxl16A2RT62 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fbxl16A2RT62 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fbxl16A2RT62 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fbxl16A2RT62 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fbxl16A2RT62 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fbxl16A2RT62 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fbxl16A2RT62 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Fbxl16A2RT62 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fbxl16A2RT62 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fbxl16A2RT62 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fbxl16A2RT62 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fbxl16A2RT62 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fbxl16A2RT62 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fbxl16A2RT62 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fbxl16A2RT62 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fbxl16A2RT62 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fbxl16A2RT62 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fbxl16A2RT62 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fbxl16A2RT62 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fbxl16A2RT62 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fbxl16A2RT62 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fbxl16A2RT62 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fbxl16A2RT62 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fbxl16A2RT62 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fbxl16A2RT62 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fbxl16A2RT62 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fbxl16A2RT62 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fbxl16A2RT62 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fbxl16A2RT62 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fbxl16A2RT62 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fbxl16A2RT62 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fbxl16A2RT62 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fbxl16A2RT62 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fbxl16A2RT62 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fbxl16A2RT62 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fbxl16A2RT62 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fbxl16A2RT62 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Fbxl16A2RT62 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fbxl16A2RT62 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fbxl16A2RT62 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fbxl16A2RT62 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fbxl16A2RT62 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fbxl16A2RT62 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fbxl16A2RT62 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fbxl16A2RT62 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Fbxl16A2RT62 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fbxl16A2RT62 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fbxl16A2RT62 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fbxl16A2RT62 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Fbxl16A2RT62 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms