Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xlr4aA2BI40 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Xlr4aA2BI40 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Xlr4aA2BI40 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Xlr4aA2BI40 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Xlr4aA2BI40 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Xlr4aA2BI40 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Xlr4aA2BI40 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Xlr4aA2BI40 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Xlr4aA2BI40 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Xlr4aA2BI40 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Xlr4aA2BI40 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Xlr4aA2BI40 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Xlr4aA2BI40 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Xlr4aA2BI40 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Xlr4aA2BI40 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Xlr4aA2BI40 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xlr4aA2BI40 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xlr4aA2BI40 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xlr4aA2BI40 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Xlr4aA2BI40 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xlr4aA2BI40 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xlr4aA2BI40 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xlr4aA2BI40 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xlr4aA2BI40 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xlr4aA2BI40 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Xlr4aA2BI40 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xlr4aA2BI40 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xlr4aA2BI40 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xlr4aA2BI40 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Xlr4aA2BI40 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Xlr4aA2BI40 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Xlr4aA2BI40 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xlr4aA2BI40 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xlr4aA2BI40 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xlr4aA2BI40 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xlr4aA2BI40 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xlr4aA2BI40 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xlr4aA2BI40 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xlr4aA2BI40 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xlr4aA2BI40 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xlr4aA2BI40 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xlr4aA2BI40 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xlr4aA2BI40 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xlr4aA2BI40 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xlr4aA2BI40 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Xlr4aA2BI40 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Xlr4aA2BI40 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xlr4aA2BI40 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xlr4aA2BI40 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xlr4aA2BI40 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xlr4aA2BI40 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xlr4aA2BI40 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xlr4aA2BI40 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xlr4aA2BI40 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xlr4aA2BI40 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xlr4aA2BI40 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Xlr4aA2BI40 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Xlr4aA2BI40 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Xlr4aA2BI40 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Xlr4aA2BI40 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Xlr4aA2BI40 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Xlr4aA2BI40 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Xlr4aA2BI40 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xlr4aA2BI40 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms