Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AgrnA2ASQ1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AgrnA2ASQ1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AgrnA2ASQ1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AgrnA2ASQ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AgrnA2ASQ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AgrnA2ASQ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AgrnA2ASQ1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AgrnA2ASQ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AgrnA2ASQ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AgrnA2ASQ1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AgrnA2ASQ1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AgrnA2ASQ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AgrnA2ASQ1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AgrnA2ASQ1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AgrnA2ASQ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AgrnA2ASQ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AgrnA2ASQ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AgrnA2ASQ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AgrnA2ASQ1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AgrnA2ASQ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AgrnA2ASQ1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AgrnA2ASQ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AgrnA2ASQ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AgrnA2ASQ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AgrnA2ASQ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AgrnA2ASQ1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AgrnA2ASQ1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AgrnA2ASQ1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AgrnA2ASQ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AgrnA2ASQ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AgrnA2ASQ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AgrnA2ASQ1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AgrnA2ASQ1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AgrnA2ASQ1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AgrnA2ASQ1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AgrnA2ASQ1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AgrnA2ASQ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AgrnA2ASQ1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AgrnA2ASQ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AgrnA2ASQ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AgrnA2ASQ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AgrnA2ASQ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AgrnA2ASQ1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AgrnA2ASQ1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
AgrnA2ASQ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AgrnA2ASQ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AgrnA2ASQ1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AgrnA2ASQ1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AgrnA2ASQ1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AgrnA2ASQ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AgrnA2ASQ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AgrnA2ASQ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AgrnA2ASQ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AgrnA2ASQ1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AgrnA2ASQ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AgrnA2ASQ1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AgrnA2ASQ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AgrnA2ASQ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AgrnA2ASQ1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AgrnA2ASQ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AgrnA2ASQ1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AgrnA2ASQ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AgrnA2ASQ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AgrnA2ASQ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AgrnA2ASQ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AgrnA2ASQ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AgrnA2ASQ1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AgrnA2ASQ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AgrnA2ASQ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AgrnA2ASQ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AgrnA2ASQ1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AgrnA2ASQ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AgrnA2ASQ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AgrnA2ASQ1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AgrnA2ASQ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AgrnA2ASQ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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