Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scn3aA2ASI5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scn3aA2ASI5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scn3aA2ASI5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scn3aA2ASI5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scn3aA2ASI5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scn3aA2ASI5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scn3aA2ASI5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Scn3aA2ASI5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
Scn3aA2ASI5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Scn3aA2ASI5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Scn3aA2ASI5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Scn3aA2ASI5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Scn3aA2ASI5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Scn3aA2ASI5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Scn3aA2ASI5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Scn3aA2ASI5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Scn3aA2ASI5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Scn3aA2ASI5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scn3aA2ASI5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scn3aA2ASI5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scn3aA2ASI5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scn3aA2ASI5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scn3aA2ASI5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scn3aA2ASI5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scn3aA2ASI5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scn3aA2ASI5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scn3aA2ASI5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Scn3aA2ASI5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Scn3aA2ASI5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Scn3aA2ASI5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Scn3aA2ASI5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Scn3aA2ASI5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scn3aA2ASI5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scn3aA2ASI5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scn3aA2ASI5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Scn3aA2ASI5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Scn3aA2ASI5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scn3aA2ASI5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scn3aA2ASI5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Scn3aA2ASI5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Scn3aA2ASI5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scn3aA2ASI5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scn3aA2ASI5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Scn3aA2ASI5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scn3aA2ASI5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scn3aA2ASI5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scn3aA2ASI5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scn3aA2ASI5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scn3aA2ASI5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scn3aA2ASI5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scn3aA2ASI5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scn3aA2ASI5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Scn3aA2ASI5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scn3aA2ASI5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scn3aA2ASI5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scn3aA2ASI5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scn3aA2ASI5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scn3aA2ASI5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scn3aA2ASI5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scn3aA2ASI5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scn3aA2ASI5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scn3aA2ASI5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scn3aA2ASI5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scn3aA2ASI5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scn3aA2ASI5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scn3aA2ASI5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scn3aA2ASI5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scn3aA2ASI5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scn3aA2ASI5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scn3aA2ASI5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scn3aA2ASI5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scn3aA2ASI5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Scn3aA2ASI5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scn3aA2ASI5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scn3aA2ASI5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scn3aA2ASI5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scn3aA2ASI5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scn3aA2ASI5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scn3aA2ASI5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scn3aA2ASI5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Scn3aA2ASI5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scn3aA2ASI5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scn3aA2ASI5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scn3aA2ASI5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Scn3aA2ASI5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scn3aA2ASI5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scn3aA2ASI5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scn3aA2ASI5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Scn3aA2ASI5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scn3aA2ASI5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scn3aA2ASI5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scn3aA2ASI5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scn3aA2ASI5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scn3aA2ASI5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Scn3aA2ASI5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Scn3aA2ASI5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scn3aA2ASI5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scn3aA2ASI5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scn3aA2ASI5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms