Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Frmpd4A2AFR3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmpd4A2AFR3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Frmpd4A2AFR3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Frmpd4A2AFR3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Frmpd4A2AFR3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Frmpd4A2AFR3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Frmpd4A2AFR3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Frmpd4A2AFR3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Frmpd4A2AFR3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Frmpd4A2AFR3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Frmpd4A2AFR3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Frmpd4A2AFR3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Frmpd4A2AFR3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Frmpd4A2AFR3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Frmpd4A2AFR3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Frmpd4A2AFR3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Frmpd4A2AFR3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Frmpd4A2AFR3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Frmpd4A2AFR3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmpd4A2AFR3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmpd4A2AFR3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmpd4A2AFR3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmpd4A2AFR3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmpd4A2AFR3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Frmpd4A2AFR3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Frmpd4A2AFR3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Frmpd4A2AFR3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Frmpd4A2AFR3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Frmpd4A2AFR3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Frmpd4A2AFR3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Frmpd4A2AFR3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Frmpd4A2AFR3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Frmpd4A2AFR3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Frmpd4A2AFR3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd4A2AFR3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd4A2AFR3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Frmpd4A2AFR3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Frmpd4A2AFR3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Frmpd4A2AFR3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Frmpd4A2AFR3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Frmpd4A2AFR3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Frmpd4A2AFR3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Frmpd4A2AFR3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Frmpd4A2AFR3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Frmpd4A2AFR3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd4A2AFR3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd4A2AFR3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd4A2AFR3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd4A2AFR3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd4A2AFR3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Frmpd4A2AFR3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Frmpd4A2AFR3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Frmpd4A2AFR3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Frmpd4A2AFR3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Frmpd4A2AFR3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Frmpd4A2AFR3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Frmpd4A2AFR3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Frmpd4A2AFR3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Frmpd4A2AFR3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd4A2AFR3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Frmpd4A2AFR3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Frmpd4A2AFR3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Frmpd4A2AFR3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Frmpd4A2AFR3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Frmpd4A2AFR3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmpd4A2AFR3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmpd4A2AFR3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmpd4A2AFR3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmpd4A2AFR3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmpd4A2AFR3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Frmpd4A2AFR3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Frmpd4A2AFR3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Frmpd4A2AFR3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Frmpd4A2AFR3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Frmpd4A2AFR3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Frmpd4A2AFR3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Frmpd4A2AFR3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Frmpd4A2AFR3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Frmpd4A2AFR3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmpd4A2AFR3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd4A2AFR3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd4A2AFR3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd4A2AFR3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd4A2AFR3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd4A2AFR3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Frmpd4A2AFR3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Frmpd4A2AFR3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Frmpd4A2AFR3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Frmpd4A2AFR3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd4A2AFR3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd4A2AFR3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd4A2AFR3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd4A2AFR3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd4A2AFR3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd4A2AFR3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd4A2AFR3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Frmpd4A2AFR3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Frmpd4A2AFR3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Frmpd4A2AFR3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms