Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem185aA2AF53 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem185aA2AF53 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem185aA2AF53 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem185aA2AF53 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem185aA2AF53 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmem185aA2AF53 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem185aA2AF53 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem185aA2AF53 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem185aA2AF53 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Tmem185aA2AF53 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem185aA2AF53 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem185aA2AF53 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem185aA2AF53 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem185aA2AF53 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem185aA2AF53 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem185aA2AF53 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem185aA2AF53 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmem185aA2AF53 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmem185aA2AF53 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem185aA2AF53 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem185aA2AF53 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem185aA2AF53 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem185aA2AF53 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem185aA2AF53 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem185aA2AF53 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem185aA2AF53 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem185aA2AF53 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmem185aA2AF53 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem185aA2AF53 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem185aA2AF53 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem185aA2AF53 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem185aA2AF53 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem185aA2AF53 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem185aA2AF53 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem185aA2AF53 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem185aA2AF53 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem185aA2AF53 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem185aA2AF53 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem185aA2AF53 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem185aA2AF53 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem185aA2AF53 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem185aA2AF53 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem185aA2AF53 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem185aA2AF53 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem185aA2AF53 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem185aA2AF53 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem185aA2AF53 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem185aA2AF53 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmem185aA2AF53 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem185aA2AF53 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem185aA2AF53 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem185aA2AF53 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem185aA2AF53 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms