Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc39aA2ACP1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc39aA2ACP1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc39aA2ACP1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc39aA2ACP1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc39aA2ACP1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc39aA2ACP1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc39aA2ACP1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc39aA2ACP1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc39aA2ACP1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc39aA2ACP1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc39aA2ACP1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc39aA2ACP1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc39aA2ACP1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc39aA2ACP1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc39aA2ACP1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc39aA2ACP1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc39aA2ACP1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc39aA2ACP1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc39aA2ACP1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc39aA2ACP1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc39aA2ACP1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc39aA2ACP1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc39aA2ACP1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc39aA2ACP1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc39aA2ACP1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc39aA2ACP1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc39aA2ACP1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc39aA2ACP1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc39aA2ACP1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc39aA2ACP1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc39aA2ACP1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc39aA2ACP1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc39aA2ACP1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc39aA2ACP1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc39aA2ACP1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc39aA2ACP1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc39aA2ACP1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc39aA2ACP1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc39aA2ACP1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc39aA2ACP1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc39aA2ACP1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc39aA2ACP1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc39aA2ACP1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc39aA2ACP1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc39aA2ACP1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc39aA2ACP1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc39aA2ACP1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc39aA2ACP1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc39aA2ACP1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc39aA2ACP1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc39aA2ACP1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc39aA2ACP1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc39aA2ACP1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc39aA2ACP1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc39aA2ACP1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc39aA2ACP1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc39aA2ACP1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc39aA2ACP1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc39aA2ACP1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc39aA2ACP1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc39aA2ACP1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc39aA2ACP1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc39aA2ACP1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc39aA2ACP1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc39aA2ACP1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc39aA2ACP1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc39aA2ACP1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc39aA2ACP1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc39aA2ACP1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc39aA2ACP1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc39aA2ACP1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc39aA2ACP1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc39aA2ACP1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc39aA2ACP1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc39aA2ACP1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc39aA2ACP1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc39aA2ACP1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc39aA2ACP1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc39aA2ACP1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc39aA2ACP1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc39aA2ACP1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc39aA2ACP1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc39aA2ACP1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc39aA2ACP1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc39aA2ACP1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc39aA2ACP1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc39aA2ACP1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc39aA2ACP1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc39aA2ACP1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc39aA2ACP1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc39aA2ACP1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc39aA2ACP1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc39aA2ACP1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc39aA2ACP1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc39aA2ACP1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc39aA2ACP1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc39aA2ACP1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc39aA2ACP1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc39aA2ACP1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms