Protein–RNA interactions for Protein: A2A5Z6

Smurf2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf2A2A5Z6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smurf2A2A5Z6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smurf2A2A5Z6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smurf2A2A5Z6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smurf2A2A5Z6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smurf2A2A5Z6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smurf2A2A5Z6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smurf2A2A5Z6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smurf2A2A5Z6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smurf2A2A5Z6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smurf2A2A5Z6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smurf2A2A5Z6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smurf2A2A5Z6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smurf2A2A5Z6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smurf2A2A5Z6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smurf2A2A5Z6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smurf2A2A5Z6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smurf2A2A5Z6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smurf2A2A5Z6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smurf2A2A5Z6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smurf2A2A5Z6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smurf2A2A5Z6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smurf2A2A5Z6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smurf2A2A5Z6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smurf2A2A5Z6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smurf2A2A5Z6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smurf2A2A5Z6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smurf2A2A5Z6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smurf2A2A5Z6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smurf2A2A5Z6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smurf2A2A5Z6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smurf2A2A5Z6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smurf2A2A5Z6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smurf2A2A5Z6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smurf2A2A5Z6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smurf2A2A5Z6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smurf2A2A5Z6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smurf2A2A5Z6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smurf2A2A5Z6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smurf2A2A5Z6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smurf2A2A5Z6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smurf2A2A5Z6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smurf2A2A5Z6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms