Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
4933424G06RikA0A140LIP3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4933424G06RikA0A140LIP3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
4933424G06RikA0A140LIP3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4933424G06RikA0A140LIP3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4933424G06RikA0A140LIP3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4933424G06RikA0A140LIP3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
4933424G06RikA0A140LIP3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4933424G06RikA0A140LIP3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4933424G06RikA0A140LIP3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4933424G06RikA0A140LIP3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4933424G06RikA0A140LIP3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4933424G06RikA0A140LIP3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
4933424G06RikA0A140LIP3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4933424G06RikA0A140LIP3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4933424G06RikA0A140LIP3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933424G06RikA0A140LIP3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933424G06RikA0A140LIP3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4933424G06RikA0A140LIP3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933424G06RikA0A140LIP3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933424G06RikA0A140LIP3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933424G06RikA0A140LIP3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933424G06RikA0A140LIP3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933424G06RikA0A140LIP3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933424G06RikA0A140LIP3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933424G06RikA0A140LIP3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933424G06RikA0A140LIP3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4933424G06RikA0A140LIP3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
4933424G06RikA0A140LIP3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4933424G06RikA0A140LIP3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4933424G06RikA0A140LIP3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
4933424G06RikA0A140LIP3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933424G06RikA0A140LIP3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933424G06RikA0A140LIP3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933424G06RikA0A140LIP3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933424G06RikA0A140LIP3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
4933424G06RikA0A140LIP3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4933424G06RikA0A140LIP3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4933424G06RikA0A140LIP3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4933424G06RikA0A140LIP3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933424G06RikA0A140LIP3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933424G06RikA0A140LIP3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933424G06RikA0A140LIP3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms