Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4921501E09RikA0A0R4J054 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4921501E09RikA0A0R4J054 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4921501E09RikA0A0R4J054 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
4921501E09RikA0A0R4J054 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4921501E09RikA0A0R4J054 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4921501E09RikA0A0R4J054 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4921501E09RikA0A0R4J054 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4921501E09RikA0A0R4J054 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4921501E09RikA0A0R4J054 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms