Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YY38

Ighv1-42, Immunoglobulin heavy variable V1-42 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ighv1-42A0A0A6YY38 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighv1-42A0A0A6YY38 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighv1-42A0A0A6YY38 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ighv1-42A0A0A6YY38 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ighv1-42A0A0A6YY38 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighv1-42A0A0A6YY38 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighv1-42A0A0A6YY38 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ighv1-42A0A0A6YY38 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighv1-42A0A0A6YY38 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighv1-42A0A0A6YY38 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighv1-42A0A0A6YY38 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ighv1-42A0A0A6YY38 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ighv1-42A0A0A6YY38 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ighv1-42A0A0A6YY38 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ighv1-42A0A0A6YY38 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighv1-42A0A0A6YY38 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighv1-42A0A0A6YY38 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ighv1-42A0A0A6YY38 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ighv1-42A0A0A6YY38 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighv1-42A0A0A6YY38 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighv1-42A0A0A6YY38 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ighv1-42A0A0A6YY38 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighv1-42A0A0A6YY38 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ighv1-42A0A0A6YY38 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighv1-42A0A0A6YY38 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighv1-42A0A0A6YY38 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighv1-42A0A0A6YY38 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ighv1-42A0A0A6YY38 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ighv1-42A0A0A6YY38 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighv1-42A0A0A6YY38 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighv1-42A0A0A6YY38 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighv1-42A0A0A6YY38 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ighv1-42A0A0A6YY38 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ighv1-42A0A0A6YY38 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ighv1-42A0A0A6YY38 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ighv1-42A0A0A6YY38 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ighv1-42A0A0A6YY38 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ighv1-42A0A0A6YY38 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ighv1-42A0A0A6YY38 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ighv1-42A0A0A6YY38 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ighv1-42A0A0A6YY38 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ighv1-42A0A0A6YY38 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ighv1-42A0A0A6YY38 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ighv1-42A0A0A6YY38 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ighv1-42A0A0A6YY38 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ighv1-42A0A0A6YY38 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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