Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trbv21A0A0A6YX06 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trbv21A0A0A6YX06 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trbv21A0A0A6YX06 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbv21A0A0A6YX06 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbv21A0A0A6YX06 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbv21A0A0A6YX06 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbv21A0A0A6YX06 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbv21A0A0A6YX06 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trbv21A0A0A6YX06 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trbv21A0A0A6YX06 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trbv21A0A0A6YX06 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trbv21A0A0A6YX06 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trbv21A0A0A6YX06 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trbv21A0A0A6YX06 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trbv21A0A0A6YX06 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trbv21A0A0A6YX06 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trbv21A0A0A6YX06 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trbv21A0A0A6YX06 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trbv21A0A0A6YX06 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trbv21A0A0A6YX06 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trbv21A0A0A6YX06 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trbv21A0A0A6YX06 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trbv21A0A0A6YX06 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trbv21A0A0A6YX06 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trbv21A0A0A6YX06 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trbv21A0A0A6YX06 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trbv21A0A0A6YX06 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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Trbv21A0A0A6YX06 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trbv21A0A0A6YX06 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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Trbv21A0A0A6YX06 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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Trbv21A0A0A6YX06 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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Trbv21A0A0A6YX06 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trbv21A0A0A6YX06 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trbv21A0A0A6YX06 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Trbv21A0A0A6YX06 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trbv21A0A0A6YX06 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trbv21A0A0A6YX06 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trbv21A0A0A6YX06 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trbv21A0A0A6YX06 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trbv21A0A0A6YX06 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trbv21A0A0A6YX06 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trbv21A0A0A6YX06 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trbv21A0A0A6YX06 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trbv21A0A0A6YX06 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trbv21A0A0A6YX06 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trbv21A0A0A6YX06 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trbv21A0A0A6YX06 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trbv21A0A0A6YX06 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trbv21A0A0A6YX06 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trbv21A0A0A6YX06 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trbv21A0A0A6YX06 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trbv21A0A0A6YX06 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trbv21A0A0A6YX06 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trbv21A0A0A6YX06 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trbv21A0A0A6YX06 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trbv21A0A0A6YX06 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trbv21A0A0A6YX06 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trbv21A0A0A6YX06 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trbv21A0A0A6YX06 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trbv21A0A0A6YX06 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trbv21A0A0A6YX06 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trbv21A0A0A6YX06 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trbv21A0A0A6YX06 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trbv21A0A0A6YX06 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trbv21A0A0A6YX06 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trbv21A0A0A6YX06 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trbv21A0A0A6YX06 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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