Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 AL049869.4-201ENST00000555669 178 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 INO80-AS1-202ENST00000560178 444 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 AC104073.4-201ENST00000632111 598 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 GNE-205ENST00000539815 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 CBWD6-203ENST00000456520 1608 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 GPR1-203ENST00000437420 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 TBCCD1-203ENST00000424280 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 HYKK-205ENST00000566332 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 C21orf140-201ENST00000410005 756 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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PDK4Q16654 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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PDK4Q16654 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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PDK4Q16654 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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PDK4Q16654 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 ALDH1A1-202ENST00000376939 822 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 AL161725.1-203ENST00000415004 1081 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 AC105393.2-201ENST00000431911 549 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 SNX18P9-201ENST00000440580 835 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PDK4Q16654 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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