Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 MIR197-201ENST00000384976 75 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 IYD-205ENST00000392256 882 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC012560.1-202ENST00000421324 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 ATP5G1P5-201ENST00000429024 411 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL137027.1-201ENST00000440358 444 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LINC02010-201ENST00000470860 516 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RN7SL563P-201ENST00000481233 298 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC008040.4-201ENST00000494834 768 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 ANKRD55-205ENST00000513241 626 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LINC02223-203ENST00000514771 781 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 CCDC58P5-201ENST00000536923 432 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL355076.3-201ENST00000555838 587 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC005790.1-201ENST00000619774 450 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL353898.2-201ENST00000623000 255 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 FBXO3-209ENST00000531080 1448 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 CEP57L1-202ENST00000368968 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 OXCT1-204ENST00000509987 1441 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.2-201ENST00000359385 269 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP18-201ENST00000390935 121 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC133644.1-201ENST00000398171 937 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL358452.1-201ENST00000414995 800 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AKR1B15-201ENST00000423958 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LINC01638-202ENST00000444114 637 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL591438.2-201ENST00000452635 691 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC055758.2-201ENST00000495382 799 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC025176.1-201ENST00000510261 365 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC026700.1-201ENST00000512074 544 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 IGLV10-67-201ENST00000519446 325 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC090539.2-201ENST00000523425 671 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC022239.1-201ENST00000527922 435 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC243972.1-201ENST00000542992 570 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RN7SL192P-201ENST00000584303 299 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL050403.2-202ENST00000603462 492 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC093909.6-201ENST00000624757 775 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC068205.4-201ENST00000637880 804 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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