Protein–RNA interactions for Protein: Q9D139

Lce1e, Late cornified envelope 1E, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce1eQ9D139 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Brip1os-201ENSMUST00000128960 4423 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Rgs9-203ENSMUST00000106704 3464 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Map3k7-203ENSMUST00000108183 5416 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Olfr873-205ENSMUST00000215540 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Gm16188-201ENSMUST00000142019 420 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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Lce1eQ9D139 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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Lce1eQ9D139 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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Lce1eQ9D139 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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Lce1eQ9D139 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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Lce1eQ9D139 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.58□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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Lce1eQ9D139 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.57□□□□□ -2
Lce1eQ9D139 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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