Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR7A18P-201ENST00000600416 277 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR6L2P-201ENST00000608207 925 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138924.1-201ENST00000629067 415 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR7A2P-202ENST00000641312 1219 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLRG1-202ENST00000356986 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CST11-201ENST00000377007 461 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHV4-34-201ENST00000390616 400 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MS4A6A-201ENST00000412309 1284 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP4F26P-202ENST00000433357 852 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049646.2-201ENST00000436848 258 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359711.1-201ENST00000441999 123 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX005266.3-201ENST00000443013 1075 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355483.1-201ENST00000450469 237 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012493.1-201ENST00000453252 760 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHFPL3-AS2-201ENST00000453666 923 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASPA-202ENST00000456349 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMA6P2-201ENST00000457574 686 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRPCP8-201ENST00000514820 211 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP190-201ENST00000516079 286 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP2-AS1-203ENST00000530002 764 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR7E87P-201ENST00000532397 929 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASA4-217ENST00000538869 483 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTR3C-205ENST00000539352 570 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244131.1-201ENST00000542152 922 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02325-203ENST00000554862 733 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf166-206ENST00000556760 851 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005552.1-201ENST00000577556 662 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL615P-201ENST00000584065 298 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL050403.2-202ENST00000603462 492 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004852.1-201ENST00000605206 154 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Metazoa_SRP.120-201ENST00000614195 252 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EAPP-205ENST00000618169 1237 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSTL1-205ENST00000619238 477 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSG8-201ENST00000306511 1441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLRG1-201ENST00000302078 1673 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MS4A6A-208ENST00000528851 1806 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVI2A-203ENST00000462804 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKZF3-207ENST00000377944 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKZF3-208ENST00000377945 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z93022.1-201ENST00000433228 1554 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms