Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU60

Atrn, Attractin, mousemouse

Predictions only

Length 1,428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrnQ9WU60 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AtrnQ9WU60 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtrnQ9WU60 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms