Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms