Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Kcnip1Q9JJ57 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Kcnip1Q9JJ57 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Kcnip1Q9JJ57 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Kcnip1Q9JJ57 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Kcnip1Q9JJ57 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Kcnip1Q9JJ57 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Kcnip1Q9JJ57 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnip1Q9JJ57 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Kcnip1Q9JJ57 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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