Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus3Q9JI38 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms