Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms