Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clvs1Q9D4C9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms