Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms