Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp3Q9CQ10 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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