Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrabdQ99JY4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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TrabdQ99JY4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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TrabdQ99JY4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrabdQ99JY4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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