Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD50Q92878 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms